TIANScriptⅡ RT קיט

פּאַסיק פֿאַר טעמפּלאַטעס מיט קאָמפּלעקס צווייטיק סטראַקטשערז און עפעקטיוו סינטעז פון לאַנג-קייט קדנאַ.

דער ינווענטאַר גיט אַלע רייידזשאַנץ פֿאַר סינטאַסייזינג דער ערשטער שטריקל פון קדנאַ, אין וואָס TIANScript II RTase איז אַ ימפּרוווד Moloney מויז לוקימיאַ ווירוס פאַרקערט טראַנסקריפּטאַסע (M-MLV), און די ימפּרוווד נייַ RTase האט אַ העכער מוסטער טעמפּאָ און נידעריקער RNase H טעטיקייט. צו לייענען דורך קאָמפּלעקס צווייטיק סטרוקטור טעמפּלאַטעס און פאַרקערט טראַנסקריפּט לאַנג פראַגמענט קדנאַ אין די סינטעז פּראָצעס פון דער ערשטער שטריקל פון קדנאַ. די 5 × TIANScript II רטאַסע באַפער צוגעשטעלט אין דעם פּראָדוקט איז קערפאַלי אָפּטימיזעד, וואָס ניט בלויז ינשורז די הויך-עפעקטיוו ענזיים טעטיקייט פון די נייַע RTase, אָבער אויך וויידאַנז די אַרייַנשרייַב קייט פון די RNA מוסטער סומע, אַזוי אַז די פאַרקערט טראַנסקריבעד קדנאַ האָבן בעסער קוואַליטעט פֿאַר סאַבסאַקוואַנט יקספּערמענאַל אַנאַליסיס.

Cat. ניין פּאַקינג גרייס
4992910 20 µl × 25 rxn
4992911 20 µl × 100 רקסנומקס

פּראָדוקט דעטאַל

עקספּערימענטאַל ביישפיל

FAQ

פּראָדוקט טאַגס

איינריכטונגען

■ הויך ענזיים טעטיקייט און עפעקטיווקייַט: הויך פאַרקערט טראַנסקריפּטאַסע טעטיקייט און גוט קאַמפּאַטאַבילאַטי אין סאַבסאַקוואַנט יקספּעראַמאַנץ.
■ ברייט סאַבסטרייט קייט: פּאַסיק פֿאַר אַלע רנאַ, ספּעציעל רנאַ טעמפּלאַטעס מיט קאָמפּלעקס צווייטיק סטראַקטשערז.
■ לאנג רט לענג: די סינטעז פון די ערשטער גדפּ פון די קדנאַ קענען דערגרייכן 12 קב.
■ פּשוט אָפּעראַציע: פשוט לייגן די פארלאנגט קאַמפּאָונאַנץ אין איין שריט אָן אַדינג קיין רייידזשאַנט בעשאַס די אָפּעראַציע.

אַפּפּליקאַטיאָנס

■ סינטעז פון קדנאַ ערשטער שנירל.
■ קאַנסטראַקשאַן פון קדנאַ ביבליאָטעק.
■ איין-שריט רט-פּקר.
■ ראַסע אַנאַליסיס.

כל די פּראָדוקטן קענען זיין קאַסטאַמייזד פֿאַר אָדם/אָעם. פֿאַר פרטים,ביטע גיט קאַסטאַמייזד סערוויס (אָדם/אָעם)


  • פֿריִערדיקע:
  • ווייטער:

  • product_certificate04 product_certificate01 product_certificate03 product_certificate02
    ×
    Experimental Example פאַרקערט טראַנסקריפּציע פיייקייט פון TIANScript II RT קיט פֿאַר פראַגמאַנץ פון פאַרשידענע לענג
    אופֿן: פאַרקערט טראַנסקריפּציע: אָפּשיקן צו די ינסטרוקטיאָן מאַנואַל פון TIANScript II RT קיט.
    רעזולטאַטן: די געל בילד ווייַזן די אַמפּלאַפאַקיישאַן רעזולטאַטן פון 10 ציל גענעס מיט פאַרשידענע לענגקטס נאָך פאַרקערט טראַנסקריפּציע פון ​​1 μ ג פון גאַנץ רנאַ. 2 μl פאַרקערט טראַנסקריפּציע פּראָדוקטן זענען לאָודיד פּער שטעג.
    אַמפּלאַפאַקיישאַן סיסטעם (פּקר): 20 μl; מוסטער מאַסע: 5 μl;
    מאַרקער: ד 15000+1 קב דנאַ לאַדער; געל קאַנסאַנטריישאַן: 1%;
    עלעקטראָפאָרעסיס טנאָים: 6 וו/סענטימעטער, 20 מין
    דיאַגראַמע פון ​​יעדער שטעג: ב: דנאַ מאַרקער; 1: פּראָדוקט לענג: 120 בפּ; 2: פּראָדוקט לענג: 1 קב; 3: פּראָדוקט לענג: 2.5 קב; 4: פּראָדוקט לענג: 3.2 קב; 5: פּראָדוקט
    לענג: 4.6 קב; 6: פּראָדוקט לענג: 6.8 קב; 7: פּראָדוקט לענג: 7.6 קב; 8: פּראָדוקט לענג: 8.9 קב; 9: פּראָדוקט לענג: 10 קב; 10: פּראָדוקט לענג: 12 קב;
    Experimental Example פאַרגלייַך פון עפעקטיווקייַט און ספּעסיפיסיטי פון TIANScript II RT קיט און פּראָדוקטן פון אנדערע סאַפּלייערז אין פאַרקערט טראַנסקריפּציע פון ​​לאַנג טעמפּלאַטעס
    מאַטעריאַלס: גאַנץ רנאַ פון מענטשלעך אַדכיראַנט סעלז.
    סטאַרטינג סומע פון ​​RT-PCR: 2 μl פאַרקערט טראַנסקריפּציע פּראָדוקט (50 נג/μl)
    אופֿן: פאַרקערט טראַנסקריפּציע: אָפּשיקן צו די ינסטרוקטיאָן מאַנואַל פון TIANScript II RT קיט.
    רעזולטאַטן: די געל בילד ווייַזן די אַמפּלאַפאַקיישאַן רעזולטאַטן פון 6 ציל גענעס מיט פאַרשידענע לענגקטס נאָך פאַרקערט טראַנסקריפּציע פון ​​1 μ ג גאַנץ רנאַ פון מענטשלעך אַדכיראַנט סעלז מיט M-MLV פֿון Supplier A און TIANGEN TIANScript II RT Kit.
    אַמפּלאַפאַקיישאַן סיסטעם (פּקר): 20 μl; מוסטער מאַסע: 5 μl;
    מאַרקער: דנאַ מאַרקערייי; געל קאַנסאַנטריישאַן: 1%; עלעקטראָפאָרעסיס טנאָים: 6 וו/סענטימעטער, 20 מין.
    דיאַגראַמע פון ​​יעדער שטעג: ב: דנאַ מאַרקער; 1: אַמפּלאַפאַקיישאַן רעזולטאַטן פון די cDNA פאַרקערט טראַנסקריבעד ניצן TIANScriptII RT קיט; 2. אַמפּלאַפאַקיישאַן רעזולטאַטן פון די קדנאַ פאַרקערט טראַנסקריבעד ניצן באַטייַטיק פּראָדוקט פון סאַפּלייער יי. די לענג פון דזשין 1 פּראָדוקט איז 1.3 קב; די לענג פון דזשין 2 פּראָדוקט איז 3.0 קב; די לענג פון דזשין 3 פּראָדוקט איז 5.0 קב; די לענג פון דזשין 4 פּראָדוקט איז 7.5 קב.
    ק: קליין אָדער קיין RT-PCR פּראָדוקט

    א -1 רנאַ איז דיגריידאַד

    - רייניקן הויך קוואַליטעט רנאַ אָן קאַנטאַמאַניישאַן. דער מאַטעריאַל פון וואָס רנאַ איז יקסטראַקטיד זאָל זיין ווי פריש ווי מעגלעך צו פאַרמייַדן רנאַ דערנידעריקונג. פונאַנדערקלייַבן רנאַ אָרנטלעכקייַט אויף דינאַטורעד געל איידער רט אָפּרוף. נאָך RNA יקסטראַקשאַן, עס זאָל זיין סטאָרד אין 100% פאָרמאַמיד. אויב RNase ינכיבאַטער איז געניצט, די באַהיצונג טעמפּעראַטור זאָל זיין <45 ° C און די pH זאָל זיין ווייניקער ווי 8.0, אַנדערש די ינכיבאַטער וועט באַפרייַען אַלע RNase געבונדן. דערצו, RNase ינכיבאַטער זאָל זיין מוסיף אין סאַלושאַנז מיט ≥ 0.8 מם דטט.

    A-2 RNA כּולל ינכיבאַטערז פון פאַרקערט טראַנסקריפּציע ריאַקשאַנז

    - פאַרקערט טראַנסקריפּציע ינכיבאַטערז אַרייַננעמען SDS, EDTA, גליסעראָול, סאָדיום פּיראָפאָספאַטע, ספּערמידינע, פאָרמאַמידע, גואַנידינע זאַלץ עטק. וואַשן רנאַ אָפּזאַץ מיט 70% (וו/וו) עטאַנאָל צו באַזייַטיקן ינכיבאַטערז.

    A-3 ניט גענוגיק אַנעאַלינג פון פּרימערס געניצט פֿאַר סינטאַסייזינג דער ערשטער שטריקל פון קדנאַ

    - באַשטימען אַז די אַנילינג טעמפּעראַטור איז פּאַסיק פֿאַר די פּרימערס געניצט אין דעם עקספּערימענט. פֿאַר טראַפ כעקסאַמערז, עס איז רעקאַמענדיד צו האַלטן די טעמפּעראַטור ביי 25 ° C פֿאַר 10 מינוט איידער איר דערגרייכן די אָפּרוף טעמפּעראַטור. פֿאַר דזשין-ספּעציפיש פּרימערס (גספּ), פּרובירן אנדערע גספּ אָדער באַשטימען צו אָליגאָ (דט) אָדער טראַפ כעקסאַמער.

    א -4 קליין סומע פון ​​סטאַרטינג רנאַ

    - פאַרגרעסערן די סומע פון ​​RNA. פֿאַר רנאַ סאַמפּאַלז ווייניקער ווי 50 נג, 0.1 μg צו 0.5 μg אַסעטיל בסאַ קענען זיין געוויינט אין דער ערשטער סטראַקטשערד cDNA סינטעז

    A-5 די ציל סיקוואַנס איז נישט אויסגעדריקט אין די אַנאַלייזד געוועבן.

    —— פרובירט אנדערע געוועבן.

    א -6 פּקר אָפּרוף פיילז

    -פֿאַר צוויי-שריט RT-PCR, די cDNA מוסטער אין די PCR שריט קען נישט יקסיד 1/5 פון די אָפּרוף באַנד.

    ק: ניט-ספּעציפיש באַנדס דערשייַנען

    A-1 ניט-ספּעציפיש אַנילינג פון פּרימערס און טעמפּלאַטעס

    —— די 3'-סוף פון פּרימערס זאָל נישט אַנטהאַלטן 2-3 דג אָדער דק. ניצן גענ-ספּעציפיש פּרימערס אין דער ערשטער שנירל סינטעז אַנשטאָט פון טראַפ-פּרימערס אָדער אָליגאָ (דט). ניצן אַ העכער אַנילינג טעמפּעראַטור אין די ערשטער סייקאַלז, און דערנאָך אַ נידעריק אַנילינג טעמפּעראַטור. ניצן הייס-אָנהייב טאַק דנאַ פּאָלימעראַסע פֿאַר פּקר צו פֿאַרבעסערן די ספּעסיפיסיטי פון דער אָפּרוף.

    A-2 נעבעך פּלאַן פון דזשין-ספּעציפיש פּרימערס

    - גיי די זעלבע פּרינציפּן פֿאַר אַמפּלאַפאַקיישאַן אָנפאַנגער פּלאַן.

    A-3 RNA קאַנטאַמאַנייטאַד מיט גענאָמיק דנאַ

    -טרעאַטש רנאַ מיט פּנקר-מיינונג דנאַסע I. שטעלן אַ קאָנטראָל אָפּרוף אָן פאַרקערט טראַנסקריפּציע צו דעטעקט דנאַ קאַנטאַמאַניישאַן.

    A-4 פאָרמירונג פון אָנפאַנגער דימער

    —— פּלאַן פּרימערס אָן קאַמפּלאַמענטשי סיקוואַנסיז אין די 3 'סוף.

    א -5 צו הויך מג2+ קאָנצענטראַציע

    —— אָפּטימיזע מג2+ קאַנסאַנטריישאַן פֿאַר יעדער מוסטער און אָנפאַנגער קאָמבינאַציע

    A-6 קאַנטאַמאַנייטאַד מיט פרעמד דנאַ

    —— ניצן אַעראָסאָל-קעגנשטעליק עצות און ודג ענזימעס.

    ק: שמיר באַנדס

    A-1 דער אינהאַלט פון דער ערשטער שנירל פּראָדוקט איז צו הויך

    - רעדוצירן די סומע פון ​​דער ערשטער שנירל פּראָדוקט אין די קאַנווענשאַנאַל פּקר אָפּרוף שריט.

    A-2 צו הויך אָנפאַנגער סומע אין פּקר אָפּרוף

    —— רעדוצירן אָנפאַנגער אַרייַנשרייַב.

    א -3 צו פילע סייקאַלז

    - אָפּטימיזע פּקר אָפּרוף טנאָים און רעדוצירן פּקר ציקל נומער.

    א -4 צו נידעריק אַנילינג טעמפּעראַטור

    —- ינקרעאַסע אַנילינג טעמפּעראַטור צו פאַרמייַדן ניט-ספּעציפיש אָנהייב און פאַרלענגערונג.

    A-5 ניט-ספּעציפיש אַמפּלאַפאַקיישאַן פון אָליגאָנוקלעאָטידע פראַגמאַנץ דזשענערייטאַד דורך דנאַסע דערנידעריקונג פון דנאַ-עקסטראַקט הויך-קוואַליטעט רנאַ צו פאַרמייַדן דנאַ קאַנטאַמאַניישאַן.

    ק: ווי צו קלייַבן פּרימערס פֿאַר RT-PCR?

    RT-PCR איז צו פאַרקערט טראַנסקריבירן רנאַ אין קדנאַ, און דערנאָך נוצן די פאַרקערט טראַנסקריבעד קדנאַ ווי אַ מוסטער פֿאַר פּקר אָפּרוף צו אַמפּלאַפיי די ציל פראַגמענט. קלייַבן אָדער טראַפ - פּרימערס, אָליגאָ דט און דזשין ספּעציפיש פּרימערס לויט די ספּעציפיש טנאָים פון דער עקספּערימענט. כל די פּרימערס אויבן קענען ווערן גענוצט פֿאַר קורץ eukaryotic cell mRNA אָן אַ שפּיגל סטרוקטור.

    טראַפ-אָנפאַנגער: פּאַסיק פֿאַר לאַנג רנאַ מיט אַ שפּיגל סטרוקטור, ווי געזונט ווי אַלע מינים פון רנאַ אַזאַ ווי ררנאַ, מרנאַ, טרנאַ, עטק. זיי זענען דער הויפּט געניצט פֿאַר רט-פּקר אָפּרוף פון איין מוסטער.

    אָליגאָ דט: פּאַסיק פֿאַר רנאַ מיט פּאָליאַ טייטינג (פּראָקאַריאָטיק רנאַ, עוקאַריאָטיק אָליגאָ דט ררנאַ און טרנאַ טאָן ניט האָבן פּאָליאַ עקן). ווייַל אָליגאָ דט איז געבונדן צו פּאָליאַ עק, די קוואַליטעט פון רנאַ סאַמפּאַלז איז הויך, און אפילו אַ קליין סומע פון ​​דערנידעריקונג וועט שטארק רעדוצירן די סומע פון ​​קדנאַ סינטעז פון פול לענג.

    גענע-ספּעציפיש אָנפאַנגער: קאַמפּלאַמענטשי צו די מוסטער סיקוואַנס, פּאַסיק פֿאַר סיטואַטיאָנס ווו די ציל סיקוואַנס איז באַוווסט.

    ק: ווי אַזוי צו באַשטעטיקן די הצלחה פון RNA פאַרקערט טראַנסקריפּציע צו דער ערשטער ברעג cDNA?

    עס זענען צוויי וועגן:

    1. אינערלעכער דערמאָנען אופֿן: אין טעאָריע, cDNA איז דנאַ פראַגמאַנץ פון פאַרשידענע לענגקטס, אַזוי דער רעזולטאַט פון ילעקטראָופעריסיס איז שמיר. אויב רנאַ שעפע איז נידעריק, קיין פּראָדוקט וועט דערשייַנען אין עלעקטראָפאָרעסטיס, אָבער דאָס קען נישט מיינען אַז קיין פּראָדוקט וועט זיין אַמפּלאַפייד דורך פּקר. אין אַלגעמיין, ינערלעך דערמאָנען קענען ווערן גענוצט צו דעטעקט קדנאַ. אויב די ינערלעך דערמאָנען האט רעזולטאַטן, די קוואַליטעט פון cDNA קענען זיין בייסיקלי געראַנטיד (אין עטלעכע פאלן, אויב די ציל דזשין פראַגמענט איז צו לאַנג, עס קען זיין יקסעפּשאַנז).

    2. אויב עס איז אַ באַוווסט דזשין אַמפּלאַפייד דורך דעם מוסטער, עס קענען זיין וועראַפייד דורך די פּרימערס פון דעם דזשין. די אַמפּלאַפאַקיישאַן פון ינערלעך דערמאָנען טוט נישט דאַווקע מיינען אַז עס איז קיין פּראָבלעם מיט cDNA. ווייַל ינערלעך דערמאָנען האט אַ שעפע פון ​​קדנאַ, עס איז גרינג צו אַמפּלאַפיי. אויב קדנאַ איז טייללי דערנידעריקט פֿון פאַרשידן סיבות, פֿון די פּערספּעקטיוו פון מאַשמאָעס, PCR רעזולטאַטן פון נידעריק גענוגיק ציל גענעס וועט זיין זייער אַפעקטאַד. כאָטש די ינערלעך דערמאָנען איז נאָך הויך אין זעט, די אַמפּלאַפאַקיישאַן וועט מיסטאָמע נישט זיין אַפעקטאַד.

    ק: רט-פּקר קענען יקספּאַנד ינערלעך דערמאָנען גענעס אָבער נישט ציל גענעס

    טייל -דיגרייד פון רנאַ. דעטעקט די אָרנטלעכקייַט און רייניקן פון RNA

    די רנאַ אינהאַלט פון פאַרשידענע מינים קען זיין אַנדערש, אָבער אין אַלגעמיין, די יקסטראַקטיד גאַנץ רנאַ זאָל אַנטהאַלטן צוויי קלאָר 28 ס און 18 ס באַנדס אין געל ילעקטראָופעריסיס, און די ברייטנאַס פון די ערשטע באַנד זאָל זיין צוויי מאָל ווי הויך ווי די פון די יענער. די 5S באַנד ינדיקייץ אַז רנאַ איז דיגריידאַד און די ברייטנאַס איז פּראַפּאָרשאַנאַל צו דער גראַד פון דערנידעריקונג. די געראָטן אַמפּלאַפאַקיישאַן פון ינערלעך דערמאָנען קען נישט מיינען אַז עס איז קיין פּראָבלעם מיט RNA, ווייַל די ינערלעך דערמאָנען איז אין גרויס זעט, רנאַ קענען זיין אַמפּלאַפייד אַזוי לאַנג ווי דער דערנידעריקונג איז נישט שטרענג. די OD260/אָד280ריין רנאַ פאַרהעלטעניש געמאסטן דורך ספּעקטראָפאָטאָמעטער זאָל זיין צווישן 1.9 און 2.1. א קליין סומע פון ​​פּראָטעין טומע אין רנאַ וועט רעדוצירן די פאַרהעלטעניש. אַזוי לאַנג ווי די ווערט איז נישט צו נידעריק, RT וועט נישט זיין אַפעקטאַד. די מערסט וויכטיק זאַך פֿאַר רט איז רנאַ אָרנטלעכקייַט.

    ק: ווי צו באַשטעטיקן די הצלחה פון RT?

    די פאַרלענגערונג פון די ינערלעך דערמאָנען דזשין קענען בלויז אָנווייַזן אַז RT איז סאַקסידאַד, אָבער עס איז ניט דאַווקע שייך צו די קוואַליטעט פון די cDNA שנירל. ווייַל די ינערלעך דערמאָנען פראַגמאַנץ זענען בכלל קליין אין גרייס און הויך אין אויסדרוק, זיי זענען גרינגער צו זיין געראָטן אין פאַרקערט טראַנסקריפּציע. אָבער, די גרייס און אויסדרוק פון ציל דזשין וועריז פון דזשין צו דזשין. די קדנאַ קוואַליטעט קענען ניט זיין געמשפט בלויז דורך ינערלעך דערמאָנען ספּעציעל פֿאַר די ציל פראַגמאַנץ מער ווי 2 קב.

    עטלעכע סאַמפּאַלז האָבן קאָמפּלעקס צווייטיק סטראַקטשערז, אָדער האָבן אַ רייַך גק אינהאַלט, אָדער זענען טייַער מיט נידעריק זעט. אין די קאַסעס, צונעמען פאַרקערט טראַנסקריפּטאַסע זאָל זיין סעלעקטעד לויט די גרייס פון דער ציל פראַגמענט און די מוסטער. פֿאַר רנאַ טעמפּלאַטעס מיט הויך גק אינהאַלט און קאָמפּלעקס צווייטיק סטרוקטור, עס איז שווער צו עפֿענען די צווייטיק סטרוקטור ביי נידעריק טעמפּעראַטור אָדער מיט פּראָסט פאַרקערט טראַנסקריפּטאַסע. פֿאַר די טעמפּלאַטעס, קוואַנט ריווערס טראַנסקריפּטאַסע קענען זיין סעלעקטעד, ווייַל די פאַרקערט טראַנסקריפּציע פאָרשטעלונג איז דאָך בעסער ווי די M-MLV סעריע פאַרקערט טראַנסקריפּטאַסע, וואָס קענען יפעקטיוולי פאַרקערט טראַנסקריבירן פאַרשידן RNA טעמפּלאַטעס און טראַנסקריבירן RNA אין די ערשטער גדפּ פון די קדנאַ. ווען גענעראַל פאַרקערט טראַנסקריפּטאַסע ינווענטאַר, 20 μl סיסטעם קענען בלויז יפעקטיוולי פאַרקערט טראַנסקריבירן 1 μ ג פון גאַנץ רנאַ. ביטע באַצאָלן ופמערקזאַמקייט צו די מאַקסימום RT קאַפּאַציטעט פון די ינווענטאַר. אויב די מוסטער איז מוסיף אין וידעפדיק, פאַרקערט טראַנסקריפּציע וועט העכערן די רנאַ מיט הויך זעט. דעריבער, עס איז בעסער נישט צו יקסיד די מאַקסימום קאַפּאַציטעט פון די סיסטעם.

    ק: רט-פּקר קענען נישט אַמפּלאַפיי די ינערלעך דערמאָנען דזשין

    א -1 באַשטימען אויב רנאַ איז סאַווירלי דיגריידאַד און אויב רט איז געראָטן

    אין אַלגעמיין, די סיבה פֿאַר די דורכפאַל פון ינערלעך דערמאָנען אַמפּלאַפאַקיישאַן איז אָפט געפֿירט דורך ערנסט רנאַ דערנידעריקונג. אן אנדער מעגלעך סיבה איז פאַרקערט טראַנסקריפּציע דורכפאַל. אינערלעכער דערמאָנען קענען ניט זיין געוויינט ווי אַ סטאַנדאַרט צו ריכטער די קוואַליטעט פון קדנאַ איין שנירל, אָבער עס קענען זיין געוויינט ווי אַ סטאַנדאַרט צו ריכטער צי פאַרקערט טראַנסקריפּציע איז געראָטן אויב עס איז קיין פּראָבלעם פון די RNA קוואַליטעט. די מערסט וויכטיק זאַך אין דעם פאַרקערט טראַנסקריפּציע פּראָצעס איז צו האַלטן אַ קעסיידערדיק טעמפּעראַטור און אַ קעסיידערדיק אָפּרוף סיסטעם צו פֿאַרבעסערן די אָפּרוף עפעקטיווקייַט.

    A-2 באַשטימען צי די פּרימערס פֿאַר אַמפּלאַפייינג ינערלעך דערמאָנען גענעס זענען פאַרלאָזלעך און אויב עס זענען קיין פראבלעמען מיט רייידזשאַנץ געניצט אין פּקר.

    ק: אויב עס איז דיטעקטאַד רנאַ מדרגה פֿאַר קאָרעוו קוואַנטיפיקאַטיאָן, איז עס נויטיק צו פאַרקערט טראַנסקריבירן אין cDNA אונטער די צושטאַנד אַז די RNA קאַנסאַנטריישאַן פון יעדער מוסטער איז קאָנסיסטענט?

    פֿאַר קאָרעוו קוואַנטיפיקאַטיאָן, RNA מוזן זיין קוואַנטיפיעד איידער פאַרקערט טראַנסקריפּציע, וואָס איז אויך פארלאנגט אין פילע פאַרקערט טראַנסקריפּציע קיץ, למשל, קוואַנטיפיי די RNA אַרייַנשרייַב ווי 1 μ ג. זינט די פאַרקערט טראַנסקריבעד קדנאַ איז אַ געמישט לייזונג, אַרייַנגערעכנט רנאַ, אָליגאָ דט, ענזיים, דנטפּ, און אפילו אַ ביסל דנאַ רעזאַדו, דיווייישאַן וועט זיין געפֿירט, אַזוי עס איז אוממעגלעך צו קוואַנטאַפיי די קדנאַ. דעריבער, רנאַ קוואַנטיפיקאַטיאָן איז נייטיק. קאָנסידערינג די פאַרקערט טראַנסקריפּציע עפעקטיווקייַט איז די זעלבע צווישן פאַרשידענע סאַמפּאַלז, די סומע פון ​​קדנאַ באקומען זאָל זיין די זעלבע, און די קוואַנטיטאַטיווע אַנאַליסיס קענען ווייַזן די פאַרגלייַך פון אויסדרוק לעוועלס פון פאַרשידענע גענעס אין דער זעלביקער סומע פון ​​גאַנץ רנאַ. ווען פּערפאָרמינג קאָרעוו פלואָרעססענסע קוואַנטיטאַטיווע פּקר, קוואַנטיטאַטיווע קדנאַ קען נישט זיין פארלאנגט נאָך פאַרקערט טראַנסקריפּציע ווייַל די ינערלעך דערמאָנען דזשין קענען זיין אַקטאַד ווי דערמאָנען.

    ק: איז עס מעגלעך צו פאַרקערט טראַנסקריפּט לאַנג פראַגמאַנץ?

    דאָס איז דער הויפּט שייך צו די גענעס, און פֿאַר רובֿ גענעס איז ניט פיזאַבאַל טראַנסקריפּציע פון ​​לאַנג פראַגמענט. פירסטלי, די עפעקטיווקייַט פון פאַרקערט טראַנסקריפּציע איז פיל נידעריקער ווי די פון PCR. צווייטנס, די GC רייַך געגנט און צווייטיק סטרוקטור פון פילע גענעס באַגרענעצן ביידע פאַרקערט טראַנסקריפּציע און PCR. צום סוף, די פאַדעלאַטי און אַמפּלאַפאַקיישאַן עפעקטיווקייַט פון פּקר זענען שווער צו גאַראַנטירן אין דער זעלביקער צייט. אין דעם פּראָצעס פון פאַרקערט טראַנסקריפּציע, קיינער קען נישט גאַראַנטירן אַ לאַנג פראַגמענט פֿאַר גענעס מיט נידעריק קאָפּיע, ספּעציעל מיט אָליגאָ דט. וועגן 5 'UTR מיט מער GC, דאָס איז אפילו מער שווער. דעריבער, עס איז נאָך אַ גלייַך וועג צו פאַרקערט טראַנסקריפּט מיט טראַפ - פּרימערס, געפֿינען די נאַטירלעך קלעאַוואַגע זייטלעך אין די ציל פראַגמענט, אַמפּלאַפיי דורך סעגמאַנץ און דורכפירן דיידזשעסטשאַן און ליגיישאַן פון ריסטריקשאַנז. אין אַלגעמיין, עס איז שווער צו גלייך פאַרגיכערן פראַגמאַנץ גרעסער ווי 2 קב, אָבער עס איז ניט שטענדיק אוממעגלעך צו באַקומען: 1. ערשטער, גאַראַנטירן די אָרנטלעכקייַט פון RNA/mRNA, און טריזאָל יקסטראַקשאַן איז בילכער. 2.מ-מלוו רט-פּקר ינווענטאַר קענען זיין גלייך געוויינט. פאַרברייטערן די אַנילינג צייט און פאַרגרעסערן די ציקל נומער אין די אַמפּלאַפאַקיישאַן פּראָצעס רעכט. אַלטערנאַטיוועלי, נעסטעד פּקר קענען זיין געווענדט, אָדער דורכפירן איין אָדער צוויי ריאַקשאַנז ערשטער מיט די רעכט צונעמען דענאַטוראַטיאָן און פאַרלענגערונג צייט איידער נאָרמאַל פּקר אַמפּלאַפאַקיישאַן, וואָס קען העלפֿן צו פאַרברייטערן פראַגמאַנץ. באַצאָלן ופמערקזאַמקייט צו די פאַדעלאַטי פון די פּאָלימעראַסע. 3.לאָנג טאַק קענען ווערן געניצט אין פּקר צו קריגן ידעאַל רעזולטאַטן. 4. פֿאַר פּראָטעין אויסדרוק אַפּלאַקיישאַן, הויך -פאַדעלאַטי פּאָלימעראַסע זאָל זיין געווענדט.

    ק: דער פּראָדוקט פֿעיִקייטן פון קוואַנט/קינג פאַרקערט טראַנסקריפּטאַסע און די חילוק צווישן TIANScript M-MLV.

    עס זענען צוויי טייפּס פון פאַרקערט טראַנסקריפּטאַסע געפֿינט דורך TIANGEN: Quant/King RTase און TIANScript M-MLV. דער הויפּט חילוק צווישן זיי איז די אַרייַנשרייַב סומע פון ​​טעמפּלאַטעס. קוואַנט איז אַ יינציק פאַרקערט טראַנסקריפּטאַסע, וואָס איז אַנדערש פון די קאַמאַנלי געוויינט M-MLV דערייווד פון Moloney Murine לוקימיאַ ווירוס. קוואַנט איז אַ נייַע הויך-עפעקטיוו פאַרקערט טראַנסקריפּטאַסע רעקאָמבינאַנטלי אויסגעדריקט דורך Escherichia coli. קוואַנט איז פּאַסיק פֿאַר אַמפּלאַפייינג 50 נג -2 μג רנאַ מיט הויך פאַרקערט טראַנסקריפּטיאָנאַל טעטיקייט און הויך טראָגן. קאַמפּערד מיט פּראָסט ממלוו אָדער אַמוו, קוואַנט ס ביגאַסט קוואַליטעט איז אַז עס האט אַ זייער שטאַרק קירבות מיט רנאַ טעמפּלאַטעס און קענען פאַרקערט טראַנסקריפּט קאָמפּלעקס טעמפּלאַטעס אָן הויך טעמפּעראַטור דענאַטוראַטיאָן. פֿאַר טעמפּלאַטעס מיט העכער גק אינהאַלט, די פאַרקערט עפעקטיווקייַט איז העכער. אָבער, דעם פאַרקערט טראַנסקריפּטאַסע האט רנאַסע ה טעטיקייט, וואָס קען ווירקן די לענג פון קדנאַ פּראָדוקט (פּאַסיק פֿאַר <4.5 קב טעמפּלאַטעס). פֿאַר קאַנווענשאַנאַל פאַרקערט טראַנסקריפּציע, TIANScript MMLV פאַרקערט טראַנסקריפּטאַסע איז רעקאַמענדיד. דעם רטאַסע איז אַ מאַדאַפייד ענזיים מיט זייער שוואַך רנאַסע ה טעטיקייט, וואָס איז פּאַסיק פֿאַר לאַנג (> 5 קב) סידעס פון קדנאַ.

    ק: ווי אַזוי צו קלייַבן צווישן איין-שריט און צוויי-שריט RT-PCR?

    איין-שריט פאַרקערט טראַנסקריפּציע און PCR אַמפּלאַפאַקיישאַן זענען געענדיקט אין דער זעלביקער רער אָן עפן די רער דעקל צווישן cDNA סינטעז און אַמפּלאַפאַקיישאַן, וואָס איז נוציק צו רעדוצירן קאַנטאַמאַניישאַן. זינט אַלע באקומען סדנאַ סאַמפּאַלז זענען געניצט פֿאַר אַמפּלאַפאַקיישאַן, די סענסיטיוויטי איז העכער מיט אַ מינימום פון 0.01 פּג פון גאַנץ רנאַ. פֿאַר געראָטן איין-שריט RTPCR, דזשין-ספּעציפיש פּרימערס זענען בכלל געניצט צו אָנהייבן cDNA סינטעז. די צוויי-שריט אופֿן, ניימלי פאַרקערט טראַנסקריפּציע און PCR אַמפּלאַפאַקיישאַן, איז דורכגעקאָכט אין צוויי סטעפּס. פירסטלי, פאַרקערט טראַנסקריפּציע איז דורכגעקאָכט פֿון אַ RNA מוסטער צו באַקומען cDNA, און די באקומען cDNA איז אונטערטעניק צו איינער אָדער מער פאַרשידענע פּקר ריאַקשאַנז. די צוויי-שריט אופֿן קענען נוצן אָליגאָ (דט) אָדער טראַפ-פּרימערס צו פירן די סינטעז פון דער ערשטער ברעג פון קדנאַ, און קענען פאַרקערט טראַנסקריבירן אַלע mRNA אינפֿאָרמאַציע פֿון אַ ספּעציפיש מוסטער.

    שרייב דיין אָנזאָג דאָ און שיקן עס צו אונדז